目前所说的食用菌和药用菌，都是真菌的一部分，由于个体较大，又称“大型真菌”。
全世界已被认识的有余种，中国已发现多种，目前认定可以人工栽培的有86种，已成为商品生产的有26种。
诸如：蘑菇、香菇、平菇、草菇、金针菇、木耳、银耳、猴头、灵芝、茯苓、猪苓、冬虫夏草、天麻等。
一、按功能分类
从对人体的作用和功能上的不同，可分为两大类：
主要提供营养的，叫：食用菌；如：香菇、蘑菇、香菇、平菇、草菇、木耳等。
主要提供药效的，叫：药用菌；如：猴头、灵芝、冬虫夏草、天麻等。实际上，兼有食、药两用的种类也很多，因此不能截然分开。
二、按培养基分类
以食用菌生长所需要的培养基质的不同，又可分为：
.草腐菌：如蘑菇、草菇、鸡腿菇等，他们以农作物的秸杆为主要的培养材料。
2.木腐菌：以锯木屑为主要培养材料，如：香菇、平菇、灵芝等。
三、生物学分类：
根据高等大型真菌的生物学和生态学特点、我国菌物科学家长期研究开发的进展，许多名贵珍稀菇菌已被人们驯化栽培，使名贵珍稀菌的类群划分发生变化。大体分以下三类：
.濒危类：
主要是那些菇种因其独特的生物学特性及对生境要求，或因产地分布区域极为狭窄，栖息地或宿主遭到严重破坏，导致种群数量急剧下降，甚至几近绝迹。
诸如：块菌、松茸、干巴菌、冬虫夏草等。据云南贸易真菌多样性调查考察，濒危类群菇菌只占整个菌物类群的.%，说明品种极少，且处境极为濒危。松茸已列入国家二级保护植物。
2.珍稀类
珍稀类群有重大的科学价值，为我国重要的自然生物可利用资源。诸如：腹牛肝菌属、红菇属、鹅膏属、轴腹菌属、鸡纵菌属。
这些珍稀种群有30多种，大都属于单型种，中国特有特殊种属，区域性分布代表类群，成为演化过程中的孑遗或残遗种，对生态环境植被恢复具有重要生物学和生态学意义。
如：羊肚菌、牛肝菌、红菇、绣球菌、白参菌、鸡纵菌等；虽有报道栽培成功，但市场产品奇缺，参考价格为：羊肚菌干品～元/千克，红菇干品元/千克，鸡纵菌鲜品50元/千克，因此仍然是稳坐“珍”位。
3.稀少类
主要指：依赖天然野生的林木外生菌根菌，和与昆虫类共生的类群。
诸如：块菌、松茸、牛肝菌、鸡土5L菌、红菇、虎奶菇、紫丁香蘑、鸡油菌、松乳菇、奥德蘑(水鸡纵)、绣球菌、青头菌、珊瑚菌、黄柄鸡油菌(喇叭菌)、梭柄乳头菇(老人头)等。这些珍稀品种产品数量极少。
《中国食用菌年鉴》年资料显示：全国松茸产量仅有吨，牛肝菌吨，羊肚菌吨。三种总和为吨，仅占列表统计的食用菌27个品种总产量。万吨的0.%，产量极为稀少，身价不凡。
因此，对于茵根性和昆虫性野生食用菌的人工培育，实现可持续利用，一直是世界的难题和创新研究的焦点。
柔软华赞赏
